Долгими десятилетиями Брюс Уэйн под маской непобедимого Бэтмена защищал жителей Готэм-сити от посягательств Сил Зла. Спустя полвека постаревший Бэтмен решает уйти на заслуженный отдых. Кто теперь остановит беспощадных злодеев? Уверенные в своей безнаказанности, они уже готовы к вторжению на городские улицы. Но о тайне Брюса Уэйна случайно узнает отважный юноша Терри Макгиннис. Облаченный в плащ Бэтмена, именно он бросает вызов беспощадным преступникам и становится новым героем Готэм-сити.

Мультсериал больше ориентирован на взрослую публику, в отличии от предыдущих типичных мультфильмов про супергероев. Стремясь сделать его более «тёмным», создатели мультсериала превысили общепринятые границы мультфильмов в этом жанре: «Бэтмен: мультсериал» стал первым мультфильмом, в котором было изображено огнестрельное вместо лазерного оружия; Бэтмен на самом деле бил руками и ногами противников, также присутствовала кровь; в дополнение ко всему, многие фоны в мультсериале были нарисованы на чёрной бумаге (стиль ар-деко с очень тёмной гаммой цвета). По началу, создатели мультсериала Тимм и Радомски столкнулись с сопротивлением и недовольством со стороны руководства студии, но успех первого фильма Бёртона о Бэтмене оказал им хорошую поддержку, тогда была выпущена пилотная серия, которая, по словам Тимма «скинула много людей с наших спин».